Die Institutsleitung des InES setzt sich aus einem Direktorium zusammen bestehend aus einem geschäftsführenden Direktor und zwei Stellvertretern:
Prof. Dr. Armin Heinzl (Geschäftsführender Direktor)
Prof. Dr. Raik Stolletz (Stellvertretender Geschäftsführender Direktor)
Prof. Dr. Heiner Stuckenschmidt (Stellvertretender Geschäftsführender Direktor)